Новий підхід прискорює персоналізоване лікування раку в молодих пацієнтів

Фахівці з Канади розробили новий спосіб швидкого підбору персоналізованого лікування для молодих пацієнтів з раком, вирощуючи їхні пухлини в курячих яйцях і аналізуючи білки.

Команда, очолювана дослідниками з Університету Британської Колумбії та Науково-дослідного інституту дитячої лікарні Британської Колумбії, першою в Канаді об’єднала ці два методи, щоб своєчасно визначити та протестувати ліки для лікування пухлини у молодого пацієнта.

Їхній успіх у пошуку нових ліків для пацієнта, описаний сьогодні в журналі EMBO Molecular Medicine, показує, як вивчення білків, відоме як протеоміка, може стати цінним доповненням до усталеного вивчення генів (геноміки) в терапії раку в режимі реального часу.

Роботу було проведено в рамках спільних зусиль програми PROFYLE (PRecision Oncology For Young peopLE), ключової ініціативи канадської мережі ACCESS (Advancing Childhood Cancer Experience, Science and Survivorship), яка об’єднує понад 30 дослідницьких і фінансувальних організацій і понад 100 дослідників зі всієї Канади з метою поліпшення результатів лікування раку в дітей і молодих дорослих.

Дослідження, проведене доктором Джорджиною Барнабас (Georgina Barnabas), було присвячене неназваному пацієнту з рідкісним видом дитячого раку, який не піддавався традиційному лікуванню.

Протеоміка: допоміжний підхід у визначенні лікування

У той час як гени містять інструкції зі створення білків, самі білки є функціональними будівельними блоками наших клітин. Більшість ліків діють шляхом зміни активності білків, тому команда задалася питанням, чи може протеоміка виявити приховані слабкі місця в пухлинах, які може пропустити генетичне тестування.

Після того як стандартна хіміотерапія не дала результатів і пухлина пацієнта стала стійкою до препарату, підібраного за допомогою геноміки, в результаті подальшого генетичного тестування не з’явилося жодного кандидата на ліки. Не зупиняючись на досягнутому, команда звернулася до протеоміки і виявила, що метаболізм пухлини значною мірою залежить від ферменту, відомого як SHMT2.

«За допомогою однієї лише геноміки ми не змогли знайти очевидного варіанту лікування, – розповідають дослідники. – Але, вивчивши білки пухлини, ми виявили критичну метаболічну слабкість, на яку ми можемо спрямувати вже схвалений препарат».

Стратегія дослідників полягала у використанні сертраліну, поширеного антидепресанту, для інгібування SHMT2 і перекриття доступу пухлини до ключового джерела енергії.

Відтворення пухлини в курячому яйці

Щоб перевірити свою ідею, команда використовувала метод, що передбачає вирощування невеликого фрагмента пухлини пацієнта в курячому яйці, яке виступає як аватарний носій пухлини. Вирощування ідентичної пухлини поза пацієнтом дало їм змогу за лічені тижні протестувати персоналізовану реакцію на ліки.

«Ця методика прискорює процес оцінки варіанту лікування настільки, що традиційні методи просто не змогли б цього зробити, — каже головний дослідник. — Ми можемо швидко перевірити, чи дійсно ліки, які ми визначили за допомогою протеоміки, можуть подіяти на пухлину пацієнта».

Аватари курячих яєць – частина ініціативи BRAvE (Better Responses through Avatars and Evidence) у BCCHR, яка об’єднує клініки з дослідницькими лабораторіями лікарні.

Команда представила свої результати групі експертів, створеної в рамках проєкту PROFYLE, які визнали сертралін найкращим варіантом лікування для пацієнта на той момент.

Обнадійливі результати, незважаючи на те, що попереду ще багато роботи

Результати були багатообіцяючими, але не цілющими. Після початку лікування сертраліном ріст пухлини пацієнта сповільнився, але не припинився, що означало необхідність додаткового лікування.

Незважаючи на те, що у вчених попереду ще багато роботи, це дослідження показує, що їхній підхід може надавати персоналізовані рекомендації з лікування досить швидко, щоб реально допомогти пацієнтам із рідкісними і важковиліковними раковими захворюваннями. Тепер можна розраховувати на застосування цього методу в інших дітей, щоб швидше знаходити ефективні методи лікування.